Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms