Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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CenpbP27790 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CenpbP27790 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpbP27790 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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