Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf1bP25119 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms