Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms