Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms