Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PparaP23204 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PparaP23204 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PparaP23204 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PparaP23204 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms