Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms