Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms