Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmnb2P21619 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms