Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms