Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms