Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms