Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VimP20152 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VimP20152 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VimP20152 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VimP20152 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms