Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms