Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms