Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18528 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18528 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18528 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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