Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18524 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18524 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18524 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18524 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18524 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18524 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18524 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18524 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18524 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18524 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms