Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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