Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp53P15975 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp53P15975 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp53P15975 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp53P15975 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms