Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrgnP13609 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms