Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms