Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms