Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms