Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctla2bP12400 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms