Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP11369 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP11369 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP11369 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms