Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spp1P10923 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms