Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms