Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms