Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6c1P0CW02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms