Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb6P09023 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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