Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LtkP08923 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LtkP08923 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LtkP08923 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LtkP08923 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LtkP08923 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LtkP08923 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtkP08923 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtkP08923 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms