Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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