Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd4P06332 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd4P06332 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd4P06332 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms