Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prp2P05143 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms