Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms