Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01810 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01810 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01810 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01810 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01810 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01810 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01810 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01810 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01810 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms