Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01808 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01808 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01808 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01808 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01808 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01808 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01808 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01808 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01808 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01808 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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