Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01671 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01671 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01671 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01671 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01671 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01671 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01671 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01671 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01671 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01671 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms