Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01668 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01668 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01668 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01668 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01668 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01668 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01668 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01668 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01668 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01668 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms