Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01665 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01665 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01665 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01665 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01665 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01665 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms