Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01652 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01652 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01652 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01652 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms