Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01638 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01638 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01638 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01638 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01638 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01638 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01638 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01638 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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