Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01636 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01636 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01636 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01636 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01636 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01636 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P01636 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01636 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms