Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms