Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl2O89104 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms