Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
F11rO88792 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
F11rO88792 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F11rO88792 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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