Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms