Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BlmO88700 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BlmO88700 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BlmO88700 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BlmO88700 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BlmO88700 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BlmO88700 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms