Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3aO88508 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms