Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms